Browsing NIVA Open Access Archive by Author "Anglès d'Auriac, Marc"
Now showing items 1-13 of 13
-
Application of UV-LEDs for antibiotic resistance genes inactivation – Efficiency monitoring with qPCR and transformation
Umar, Muhammad; Anglès d'Auriac, Marc; Wennberg, Aina Charlotte (Peer reviewed; Journal article, 2021)A dose-response study on a plasmid vector containing ampicillin and kanamycin resistance genes was performed with UVC-LEDs at two different wavelengths (265 and 285 nm) using different UV fluences including 40 mJ/cm2 and ... -
Associations Between Behavioral Effects of Bisphenol A and DNA Methylation in Zebrafish Embryos
Olsvik, Pål Asgeir; Whatmore, Paul; Penglase, Samuel; Skjærven, Kaja Helvik; Anglès d'Auriac, Marc; Ellingsen, Ståle (Journal article; Peer reviewed, 2019)Endocrine-disrupting contaminants have been associated with aberrant changes in epigenetic pathways in animals. In this study, zebrafish embryos were exposed bisphenol A (BPA) to search for associations between behavior ... -
Blue Carbon eDNA – A novel eDNA method to trace macroalgae carbon in marine sediments
Anglès d'Auriac, Marc; Hancke, Kasper; Gundersen, Hege; Frigstad, Helene; Borgersen, Gunhild (NIVA-rapport;7648, Research report, 2021)Blue forests, such as rockweed beds and seagrass meadows, are considered important natural sinks for carbon and thereby play a vital role in climate regulation, mitigation and adaptation. Kelp forests grow on rocky bed ... -
Combined membrane filtration and 265 nm UV irradiation for effective removal of cell free antibiotic resistance genes from feed water and concentrate
Krzeminski, Pawel; Feys, Edward; Anglès d'Auriac, Marc; Wennberg, Aina Charlotte; Umar, Muhammad; Schwermer, Carsten Ulrich; Uhl, Wolfgang (Peer reviewed; Journal article, 2020)The removal of cell free DNA (plasmids) carrying antibiotic resistance genes (ARGs) was investigated at bench-scale using ultrafiltration (UF), nanofiltration (NF) and reverse osmosis (RO) membranes commonly applied in ... -
Dead or alive — Old empty shells do not prompt false-positive results in environmental DNA surveys targeting the freshwater pearl mussel (Margaritifera margaritifera L.)
Rasmussen, Jes Jessen; Andersen, Liselotte Wesley; Johnsen, Trine Just; Thaulow, Jens; Anglès d'Auriac, Marc; Thomsen, Søren Nøhr; Hesselsøe, Martin (Peer reviewed; Journal article, 2021)Environmental DNA (eDNA) from water samples is increasingly used to detect the presence and distribution of species in aquatic ecosystems. However, before implementing eDNA in monitoring programmes, various species-specific ... -
Efficient coralline algal psbA mini barcoding and High Resolution Melt (HRM) analysis using a simple custom DNA preparation
Anglès d'Auriac, Marc; Le Gall, Line; Peña, Viviana; Hall-Spencer, Jason M.; Steneck, Robert S.; Fredriksen, Stein; Gitmark, Janne Kim; Christie, Hartvig C; Husa, Vivian; Grefsrud, Ellen Sofie; Rinde, Eli (Journal article; Peer reviewed, 2019)Coralline algae form extensive maerl and rhodolith habitats that support a rich biodiversity. Calcium carbonate harvesting as well as trawling activities threatens this ecosystem. Eleven species were recorded so far as ... -
High-throughput analyses and Bayesian network modeling highlight novel epigenetic Adverse Outcome Pathway networks of DNA methyltransferase inhibitor mediated transgenerational effects
Song, You; Kamstra, Jorke H; Cao, Yang; Asselman, Jana; Anglès d'Auriac, Marc; Friberg, Nikolai (Peer reviewed; Journal article, 2021)A number of epigenetic modulating chemicals are known to affect multiple generations of a population from a single ancestral exposure, thus posing transgenerational hazards. The present study aimed to establish a high-throughput ... -
Kartlegging av et utvalg marine naturtyper i Oslofjorden
Rinde, Eli; Bekkby, Trine; Kvile, Kristina Øie; Andersen, Guri Sogn; Brkljacic, Marijana Stenrud; Anglès d'Auriac, Marc; Christie, Hartvig C; Fagerli, Camilla With; Fredriksen, Stein; Moy, Siri Røang; Staalstrøm, Andre; Tveiten, Lise Ann (NIVA-rapport;7605, Research report, 2021)Formålet med prosjektet har vært å skaffe kunnskap om et utvalg marine naturtyper i Oslofjorden, og samtidig skaffe praktisk erfaring med NiN-systemet som verktøy for å dekke miljøforvaltningens behov. Gjennom feltkartlegging ... -
Lithothamnion (Hapalidiales, Rhodophyta) in the changing Arctic and Subarctic: DNA sequencing of type and recent specimens provides a systematics foundation
Peña, Viviana; Bélanger, David; Gagnon, Patrick; Richards, Joseph L.; Gall, Line Le; Hughey, Jeffery R.; Saunders, Gary W.; Lindstrom, Sandra C.; Rinde, Eli; Husa, Vivian; Christie, Hartvig C; Fredriksen, Stein; Hall-Spencer, Jason M.; Steneck, Robert S.; Schoenrock, Kathryn M.; Gitmark, Janne Kim; Grefsrud, Ellen Sofie; Anglès d'Auriac, Marc; Legrand, Erwann; Grall, Jacques; Mumford, Thomas F.; Kamenos, Nicholas A.; Gabrielson, Paul W. (Peer reviewed; Journal article, 2021)Coralline red algae in the non-geniculate genera Clathromorphum, Phymatolithon and Lithothamnion are important benthic ecosystem engineers in the photic zone of the Arctic and Subarctic. In these regions, the systematics ... -
Overvåking og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk og vasspest ved bruk av miljø-DNA
Engesmo, Anette; Kistenich, Sonja; Knudsen, Steen Wilhelm; Christensen, Guttorm; Hesselsøe, Martin; Anglès d'Auriac, Marc (NIVA-rapport;7623, Research report, 2021)Tidligere publiserte molekylære deteksjonssystemer for fem invaderende fiskearter (pukkellaks, gjedde, ørekyt, sørv og suter) ble evaluert i henhold til Thalingers valideringsskala. Deretter ble det samlet miljø-DNA prøver ... -
Overvåking og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk ved bruk av miljø-DNA
Engesmo, Anette; Knudsen, Steen Wilhelm; Christensen, Guttorm; Hesselsøe, Martin; Anglès d'Auriac, Marc (NIVA-rapport;7435, Research report, 2019)Dette prosjektet er gjennomført på oppdrag fra Miljødirektoratet og målsetningen var å utvikle og teste ut et system for bruk av miljø-DNA som supplerende verktøy i overvåkning og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk for ... -
Overvåking og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk ved bruk av miljø-DNA 2021
Engesmo, Anette; Egge, Elianne Dunthorn; Knudsen, Steen Wilhelm; Christensen, Guttorm; Hesselsøe, Martin; Anglès d'Auriac, Marc (NIVA-rapport;7732-2022, Research report, 2022)Det ble samlet miljø-DNA prøver fra Akersvannet og Virikbekken som ble analysert for gjedde og ørret. Resultatene viste et forutsigbart mønster i Virikbekken, med størst konsentrasjon av gjedde DNA øverst og størst ... -
Tilpasning av en kvantitativ PCR metode for deteksjon av Prymnesium parvum i sjøvann
Dale, Trine; Anglès d'Auriac, Marc; Hobæk, Anders (NIVA-rapport;7757-2022, Research report, 2022)Et fellestrekk ved flere av de algene som skaper problemer i akvakultur er at den konvensjonelle metoden for deteksjon og mengdebestemmelse er mikroskop. Når det gjelder skadelige alger er mange arter små og skjøre og blir ...