Vis enkel innførsel

dc.contributor.authorDale, Trine
dc.contributor.authorAnglès d'Auriac, Marc
dc.contributor.authorHobæk, Anders
dc.date.accessioned2022-07-15T10:03:27Z
dc.date.available2022-07-15T10:03:27Z
dc.date.created2022-07-14T10:07:44Z
dc.date.issued2022
dc.identifier.isbn978-82-577-7493-6
dc.identifier.issn1894-7948
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11250/3005719
dc.descriptionProsjektleder Trine Daleen_US
dc.description.abstractEt fellestrekk ved flere av de algene som skaper problemer i akvakultur er at den konvensjonelle metoden for deteksjon og mengdebestemmelse er mikroskop. Når det gjelder skadelige alger er mange arter små og skjøre og blir lett ødelagt ved konservering. Flere arter er vanskelige å identifisere og identifisering krever kvalifisert personell med mye praktisk erfaring. Realtime og kvantitativ real-time PCR (qPCR) metodene er blant de alternative metodene som har blitt testet i overvåkningsøyemed. Helt fra slutten av 1980 tallet har blomstringer av svepeflagellaten Prymnesium parvum vært et problem i Hylsfjorden og tilgrensende fjordsystem, hvor den periodevis har forårsaket betydelig dødelighet hos oppdrettsfisk. Med utgangspunkt i publiserte protokoller har vi tilpasset/utviklet assays for identifisering av P. parvum i vannprøver. I 2018 ble protokollen testet ut i overvåkningsprogrammet som Grieg Seafood Rogaland kjører hver sommer i Hylsfjorden. Programmet av ukentlige vannprøver fra to dyp i perioden mai til desember. Det antydes en deteksjonsgrense på 1000 celler/L ved bruk av denne protokollen. Det ble detektert forekomster av P. parvum i fire prøver med qPCR metoden. P. parum ble ikke detektert med mikroskopi i noen prøver dette året. Lav deteksjonsgrense er viktig fordi det kan avdekke en blomstring som er under oppbygging og dermed gi oppdrettere bedre tid til å iverksette tiltak.en_US
dc.language.isonoben_US
dc.publisherNorsk institutt for vannforskningen_US
dc.relation.ispartofNIVA-rapport
dc.relation.ispartofseriesNIVA-rapport;7757-2022
dc.subjectAkvakulturen_US
dc.subjectAquacultureen_US
dc.subjectQPCRen_US
dc.subjectQPCRen_US
dc.subjectLaksen_US
dc.subjectAtlantic salmonen_US
dc.subjectPrymnesium parvumen_US
dc.subjectPrymnesium parvumen_US
dc.titleTilpasning av en kvantitativ PCR metode for deteksjon av Prymnesium parvum i sjøvannen_US
dc.typeResearch reporten_US
dc.description.versionpublishedVersionen_US
dc.rights.holder© Norsk institutt for vannforskning. Publikasjonen kan siteres fritt med kildeangivelse.en_US
dc.subject.nsiVDP::Matematikk og naturvitenskap: 400en_US
dc.subject.nsiVDP::Mathematics and natural scienses: 400en_US
dc.source.pagenumber17en_US
dc.source.issue7757-2022en_US
dc.identifier.cristin2038302
cristin.ispublishedtrue
cristin.fulltextoriginal


Tilhørende fil(er)

Thumbnail

Denne innførselen finnes i følgende samling(er)

Vis enkel innførsel