• A baseline study of the occurrence of non-indigenous species in Danish harbours 

      Andersen, Jesper Harbo; Kallenbach, Emilie; Kjeldgaard, Mathias Brink; Knudsen, Steen Wilhelm; Eikrem, Wenche; Fagerli, Camilla With; Oug, Eivind; Dale, Trine; Thaulow, Jens; Gitmark, Janne Kim; Hobæk, Anders; Green, Norman Whitaker; Hesselsøe, Martin; Støttrup, Josianne; Kuhn, Jesper; Bekkevold, Dorte; Jacobsen, Lars Magnus Wulf; Møller, Peter Rask; Olesen, Christian Aakjær; Carl, Henrik; Stuer-Lauridsen, Frank (NIVA-rapport;7769-2022, Research report, 2022)
      We report the first ever nation-wide study of the occurrence of non-indigenous species in Danish harbours. The sampling was car-ried out using both conventional and biomolecular methods (eDNA). In total, 16 harbours were ...
    • Detektion af miljø-DNA med ‘quantitative Polymerase Chain Reaction’ (qPCR) sammenlignet med ‘droplet digital Polymerase Chain Reaction’ (ddPCR) 

      Knudsen, Steen Wilhelm (NIVA-rapport;7872-2023, Research report, 2023)
      Detektion af miljø-DNA (engelsk: ‘environmental DNA’, forkortet: ‘eDNA’) kan gøres med blandt andet qPCR og ddPCR, hvor ddPCR ved detektion af DNA fra virus eller bakterier i human patologiske studier er blevet demonstreret ...
    • Development of species-specific eDNA-based test systems for monitoring of freshwater crayfish 

      Knudsen, Steen Wilhelm; Agersnap, Sune; Møller, Peter Rask; Andersen, Jesper Harbo (NIVA-rapport;7447, Research report, 2019)
      This MONIS 5 report focuses on freshwater crayfish and was funded by the Danish Environmental Protection Agency. The aim of the present study was to develop species-specific systems for tracking environmental DNA (eDNA) ...
    • Development of species-specific eDNA-based test systems for monitoring of non-indigenous Decapoda in Danish marine waters 

      Knudsen, Steen Wilhelm; Møller, Peter Rask (NIVA-rapport;7544, Research report, 2020)
      We report the development of seven eDNA-based species-specific test systems for monitoring of marine Decapoda in Danish marine waters. The seven species are 1) Callinectes sapidus (blå svømmekrabbe), 2) Eriocheir sinensis ...
    • ECOMAR: A data-driven framework for ecosystem-based Maritime Spatial Planning in Danish marine waters. Results and conclusions from a development and demonstration project 

      Andersen, Jesper Harbo; Bendtsen, Jørgen; Hammer, Kathrine Jul; Harvey, E. Therese; Knudsen, Steen Wilhelm; Murray, Ciaran Joseph; Carstensen, Jacob; Petersen, Ib Krag; Svegaard, Signe; Tougaard, Jakob; Edelvang, Karen; Egekvist, Josefine; Olsen, Jeppe; Vinther, Morten; Al-Hamdani, Zyad; Jensen, Jørn Bo; Leth, Jørgen O; Kaae, Berit C; Olafsson, Anton Stahl; McClintock, William E.; Burt, Chad; Yocum, Dan (NIVA-rapport;7562, Research report, 2020)
      We report the developments and results of the ECOMAR project, which have taken place 2018-2020 and was funded by THE VELUX FOUNDATIONS. ECOMAR has established state-of-the-art data sets for the distribution of human ...
    • Ikke-hjemmehørende arter i marine områder 

      Andersen, Jesper Harbo; Knudsen, Steen Wilhelm; Murray, Ciaran Joseph; Carl, Henrik; Møller, Peter Rask; Hesselsøe, Martin (NIVA-rapport;7658, Research report, 2021)
      Denne rapport omhandler ikke-hjemmehørende arter i de danske farvande og består af to dele. Den første vedrører en opdate-ring af den nationale liste over ikke-hjemmhørende arter i de danske farvande – også kaldet NIS-listen. ...
    • Kortlægning af flodperlemusling i Varde Å-systemet ved brug af eDNA – en eftersøgning af nålen i høstakken 

      Rasmussen, Jes Jessen; Wyrwik, Christoffer; Sørensen, Mathias; Deacon, Michael; Sørensen, Flemming; Pedersen, Jan; Knudsen, Steen Wilhelm (NIVA-rapport;7818-2023, Research report, 2023)
      I dette studie blev der taget vandprøver i Varde Å, Linding Å, Ansager Å, Grindsted Å og Holme Å til kortlægning af forekomster af flodperlemusling ved brug af eDNA. Analyserne blev foretaget på en digital droplet PCR-platform, ...
    • Overvåking og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk og vasspest ved bruk av miljø-DNA 

      Engesmo, Anette; Kistenich, Sonja; Knudsen, Steen Wilhelm; Christensen, Guttorm; Hesselsøe, Martin; Anglès d'Auriac, Marc (NIVA-rapport;7623, Research report, 2021)
      Tidligere publiserte molekylære deteksjonssystemer for fem invaderende fiskearter (pukkellaks, gjedde, ørekyt, sørv og suter) ble evaluert i henhold til Thalingers valideringsskala. Deretter ble det samlet miljø-DNA prøver ...
    • Overvåking og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk ved bruk av miljø-DNA 

      Engesmo, Anette; Knudsen, Steen Wilhelm; Christensen, Guttorm; Hesselsøe, Martin; Anglès d'Auriac, Marc (NIVA-rapport;7435, Research report, 2019)
      Dette prosjektet er gjennomført på oppdrag fra Miljødirektoratet og målsetningen var å utvikle og teste ut et system for bruk av miljø-DNA som supplerende verktøy i overvåkning og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk for ...
    • Overvåking og kartlegging av fremmed ferskvannsfisk ved bruk av miljø-DNA 2021 

      Engesmo, Anette; Egge, Elianne Dunthorn; Knudsen, Steen Wilhelm; Christensen, Guttorm; Hesselsøe, Martin; Anglès d'Auriac, Marc (NIVA-rapport;7732-2022, Research report, 2022)
      Det ble samlet miljø-DNA prøver fra Akersvannet og Virikbekken som ble analysert for gjedde og ørret. Resultatene viste et forutsigbart mønster i Virikbekken, med størst konsentrasjon av gjedde DNA øverst og størst ...
    • Supplementary material to ECOMAR: A data-driven framework for ecosystembased Maritime Spatial Planning in Danish marine waters 

      Andersen, Jesper Harbo; Hammer, Kathrine Jul; Harvey, E. Therese; Knudsen, Steen Wilhelm; Murray, Ciaran Joseph; Carstensen, Jacob; Petersen, Ib Krag; Sveegaard, Signe; Tougaard, Jakob; Edelvang, Karen; Olsen, Jeppe; Vinther, Morten; Al-Hamdani, Zyad; Jensen, Jørn Bo; Leth, Jørgen O; Kaae, Berit C; Olafsson, Anton S (NIVA-rapport;7525, Research report, 2020)
      This report contains, as said in the title, the supplementary material to the synthesis report from the ECOMAR project (2018- 2020). The supplementary material consists of three parts: 1) Annex A, being the data sets and ...
    • Tekniske anvisninger for eDNA-baseret overvågning af ikke-hjemmehørende marine arter 

      Knudsen, Steen Wilhelm; Andersen, Jesper Harbo; Bekkevold, Dorte; Hesselsøe, Martin; Jensen, Søren K S; Møller, Peter Rask (NIVA-rapport;7455, Research report, 2020)
      Disse tekniske anvisninger er en revideret udgave af de ansvisninger, der tidligere er udarbejdet for Miljøstyrelsen og publiceret vinteren 2017/2018. De reviderede tekniske anvisninger indeholder en detaljeret protokol ...